Rektor: prof. dr. Marjan Blažič
Senat: člani senata so po funkciji rektor in dekani fakultet, dva člana imenuje študentski svet univerze
Upravni odbor sestavljajo predstavniki fakultet - ustanoviteljic univerze in scer Jože Derganc, predsednik, predstavnik UNM FEI, Tanja Radovan, predstavniva UNM FPUV, mag. Ana Blažič, predstavnica UNM FZV in dr. Franci Merzel, predstavnik UNM FS.
Študenski svet sestavljajo predsednik študentskih svetov fakultet.
Senat ima komisije za:
- izobraževanje, ki jo sestavljajo prorektor, zadolžen za področje izobraževanja, ki je predsednik komisije, prodekani članic, zadolženi za študijske zadeve.
- raziskovalno in razvojno delo ter inovacije v sestavi prorektor, zadolžen za področje znanstveno raziskovalnega in inovativnega dela, ki je predsednik komisije, in prodekani članic, zadolženi za raziskovalno dejavnost (oz. predsedniki komisij članic za raziskovalno dejavnost).
- habilitacije, v kateri je vsaka znanstvena disciplina, ki je predmet delovanja članic univerze, zastopana z enim članom, izvoljenim v naziv rednega profesorja.
- mednarodno in meduniverzitetno sodelovanje, ki jo sestavljajo prorektor, zadolžen za področje znanstveno raziskovalnega in inovativnega dela, ki je predsednik komisije in prodekani članic zadolženi za mednarodno sodelovanje (oz. predsedniki komisij članic za mednarodno sodelovanje), in študent, ki ga na predlog študentskega sveta univerze imenuje senat univerze.
- kakovost v sestavi prorektor, zadolžen za področje kakovosti, predsedniki komisij za kakovost članic univerze in študent, ki ga predlaga študentski svet univerze
- za etiko v raziskavah, ki vključujejo delo z ljudmi, v kateri so trije visokošolski učitelji z večletnimi izkušnjami v raziskovalnem delu, ki vključujejo delo z ljudmi, in lahko podajajo mnenje o vplivu in morebitnih posledicah raziskave na udeležence, vključene v raziskavo, ki jih imenuje senat univerze in en študent doktorskega študijskega programa, ki ga imenuje študentski svet univerze.
- nagrade in priznanja v sestvi rektor, glavni tajnik in študent, ki ga imenuje študentski svet univerze.